Structure de référence sur son territoire, le Conservatoire botanique national de Franche-Comté – Observatoire régional des Invertébrés (CBNFC-ORI) est en charge de : la connaissance de la flore sauvage, des habitats naturels et de l’entomofaune, la gestion et la valorisation des données naturalistes, la conservation de la flore et de l’entomofaune rares et/ou menacées, l’expertise et appui technique dans ses domaines de compétences, l’information, la sensibilisation et la mobilisation du public et des pouvoirs publics. Agréé par le Ministère de la Transition écologique, il appartient au réseau des Conservatoires botaniques nationaux, dont les missions en faveur de la diversité végétale et fongique sont reconnues d'intérêt général.